1.有的代理记账企业没有与委托单位签订正式的委托代理协议，对彼此的权力.责任缺乏具体规定，在日常工作中遇到问题，无法区分义务。因此，在选择代理记账公司时，公司需要更加谨慎。
2.某些“代理记账企业”没有代理记账资格证书(市财政局批准的代理记账许可证).会计证书等。)，问题可以逃避义务，危害委托单位的利益。这也是中小企业在选择代理服务公司时必须考虑的事情。
3.财务软件必须到财政局备案才能申请，有的记账单位没有选择财政部批准的财务软件代替手工记账。
4.财务会计数据交接不便.标准不足。代理记账单位接受委托单位会计凭证和资料时，未办理交接手续，丢失或损坏时难以搜索。
5.记账单位一般按时或定期上门服务，日常业务流程可通过电话联系，财务会计不在单位随时随地申请咨询
